砷及其化合物具有毒性，所以当人体砷摄入量过多时，就会造成砷中毒。一般来说，无机砷比有机砷的毒性大，三价砷比五价砷的毒性大。砷的氧化物(如三氧化二砷)和盐类绝大部分属高毒，而砷化氢则属剧毒物质，是目前已知的砷化合物中毒性最大的一个。过量的砷会干扰细胞的正常代谢，影响呼吸和氧化过程，使细胞发生病变。
砷还可直接损伤小动脉和毛细血管壁，并作用于血管舒缩中枢，导致血管渗透性增加，引起血容量降低，医用微量元素分析仪了解其加重脏器损害。三氧化二砷和三氧化砷对眼、上呼吸道和皮肤均有刺激作用。
砷是可发现的最有毒的元素之一。尽管他们的毒性作用，地球上的无机砷债券自然发生少量。人类可能通过食物，水和空气接触到砷。曝光也可能会发生通过与土壤或水的皮肤接触，包含砷，砷在食物级别是比较低的，因为它不会由于其毒性加入。
在生活中，人们可能会因为误服砷化物或食用受到砷污染的食物而导致砷中毒，如小孩误食含砷的杀虫剂而导致砷中毒。另外，在使用无机砷与其化合物的工厂工作的工人也可能会因为接触有毒的砷化物而发生中毒。所以医用微量元素分析仪建议也应适当注意体的砷含量是否正常，避免出现砷中毒。
